Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX6O95503 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX6O95503 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX6O95503 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX6O95503 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX6O95503 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX6O95503 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms