Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX3O95343 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX3O95343 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms