Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms