Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CYTIPO60759 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CYTIPO60759 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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