Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TO15178 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TO15178 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TO15178 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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