Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
O00370 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
O00370 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
O00370 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
O00370 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
O00370 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
O00370 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms