Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms