Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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USP15Q9Y4E8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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