Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVW-1Q9UQF0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms