Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms