Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms