Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRHQ9HD43 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms