Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms