Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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KRTAP9-9Q9BYP9 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMS3-201ENST00000273139 1598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 OR1N1-201ENST00000304880 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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