Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms