Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPAP2Q8IXW5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms