Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms