Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms