Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27BQ5VT28 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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