Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms