Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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