Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CDKN3Q16667 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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