Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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