Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC009166.1-201ENST00000570060 487 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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