Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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