Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IHHQ14623 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms