Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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