Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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