Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PMS2P3Q13401 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PMS2P3Q13401 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PMS2P3Q13401 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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