Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms