Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms