Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms