Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms