Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMTNP53814 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMTNP53814 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms