Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms