Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms