Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms