Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA4P35212 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms