Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms