Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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