Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRHP20396 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRHP20396 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRHP20396 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHP20396 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRHP20396 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRHP20396 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms