Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NELFEP18615 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NELFEP18615 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NELFEP18615 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NELFEP18615 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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