Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms