Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI2P10070 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI2P10070 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI2P10070 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI2P10070 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI2P10070 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI2P10070 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms