Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC192P0DO97 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms