Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms