Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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