Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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