Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YBX2Q9Y2T7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms