Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms